1.辣椒根腐病的病原菌为腐皮镰孢菌，在土壤可以存活10年以上，传播渠道主要靠肥料、工具、雨水及流水传播。辣椒根腐病多发生于定植后。发病初期病株枝叶特别是顶部叶片稍见萎蔫，傍晚至次日早晨恢复，症状反复数日后叶片全部萎蔫，但叶片仍呈绿色。病株的根茎部及根部皮层呈淡褐色及深褐色腐烂，极易剥离，露出木质部；横切茎观察，可见维管束变褐色，后期潮湿时可见病部长出白色至粉红色霉层。2.杜绝初侵染源。正常的情况辣椒苗要自己育，如需要购买苗子，绝对不要在发病区购买，以有效杜绝因购买苗子而引起辣椒根腐病的传播发生。3.科学管理，防止积水。整地时一头要挖好排水沟；采用垄栽，做成90厘米宽的高垄，一垄栽双行，既利于提早封垄，又利于通风采光和田间管理；使用充分腐熟的有机肥，中后期追肥，采用配制好的复合肥母液随浇水时浇施，或顺垄撒施后浇水，防止人为管理造成辣椒根部受伤。4.病株处理。如在辣椒田里发现一株或几株出现中午萎蔫，晚上稍恢复的情况，就应立即拔除，带出田外烧掉，然后用土拌石灰掩埋辣椒病穴。5.加强栽培管理。据调查，同一地块高垄栽培比低垄栽培明显发病轻，用塑料薄膜覆盖发病轻，因此建议菜农应高垄栽培并用塑料薄膜覆盖。不要大水漫灌，有条件可进行滴灌，保持土壤半干半湿状态，及时增施磷钾肥，增强抗病力。6.药剂防治。⑴定植时用抗枯灵可湿性粉剂900倍液或恶霉灵可湿性粉剂300倍液浸根10～15分钟。⑵定植缓苗后，在发病前用向农4号可湿性粉剂 800倍液加强力生根剂，隔7～10天对辣椒逐株灌根，连续3～4次。⑶定植后浇水时，随水加入硫酸铜冲入田中，每亩用量为1.5～2公斤，可减轻发病。 ⑷发病初期用药剂进行喷洒或浇灌，如50%多菌灵可湿性粉剂500倍液、50%甲基托布津可湿性粉剂500倍液、75%敌克松可湿性粉剂800倍液等，每亩喷药液50升，隔10天左右喷1次，连续喷2～3次，采果前3天停止用药。

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